中国生物多样性信息系统包括五个学科分部信息系统及信息源点信息系统：

1. 中心信息系统 (北京,中国科学院植物研究所)
2. 五个学科分部
   1. 植物学分部（北京植物所植物园）
   2. 动物学分部（北京动物所）
   3. 微生物学分部（北京微生物所）
   4. 淡水生物学分部（武汉水生所）
   5. 海洋生物学分部（南海海洋所） 或 镜像站点
3. 廿六个信息源点:

   生态系统定位站、自然保护区

   1. 长白山森林生态系统定位研究站
   2. 北京森林生态系统定位研究站
   3. 内蒙古草原生态系统定位研究站
   4. 海北高寒草甸生态系统试验站
   5. 东湖水生生态系统定位研究站
   6. 鄂尔多斯沙地草地生态系统定位研究站
   7. 神农架生物多样性研究站
   8. 大亚湾海洋生态系统定位研究站
   9. 鼎湖山森林自然保护区
   10. 珠穆朗玛峰自然保护区
       

       标本馆

   11. 中国科学院植物研究所标本馆
   12. 中国科学院动物研究所标本馆
   13. 中国科学院微生物研究所标本馆
   14. 中国科学院华南植物所标本馆
   15. 中国科学院沈阳应用生态所标本馆
   16. 中国科学院昆明植物所标本馆
   17. 中国科学院昆明动物所标本馆
       

       植物园

   18. 昆明植物园
   19. 西双版纳植物园
   20. 华西亚高山植物园
   21. 武汉植物园
   22. 华南植物园
   23. 北京植物园
       

       库

   24. 昆明动物研究所细胞库
   25. 昆明中国濒危植物种质资源库
   26. 中国科学院遗传所

         相关站点:

植物生态学与生物多样性保育研究中心

中国科学院植物研究所植被数量生态学开放实验室（院级开放实验室）

分布于荒漠与草原区的鄂尔多斯沙地草地生态系统定位研究站

典型草原区的内蒙古草原生态系统定位研究站(院级开放站)

暖温带森林区的北京森林生态系统定位研究站

东部亚热带的神农架生物多样性定位研究站

西部亚热带的华西亚高山植物园

中国科学院生态系统研究网络(CERN)生物分中心

中国可持续发展信息资源共享－植物与植被信息资源共享

   

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